보건복지부가 전국 응급의료기관을 대상으로 실시한 인력 시설 장비에 대한 2006년도 평가에서 군산의료원은 지역응급의료센터 부문 A등급을 받았다.

지역응급의료기관 평가에서 동군산병원은 B 등급, 군산 차병원은 F 등급을 받았다. 

보건복지부에 따르면 이번 평가는 응급의료전문가, 시민단체, 시·도 직원 등으로 평가단을 구성해 2006년 9월 7일부터 12월 5일까지 3개월간 지역응급의료센터 98개소, 지역응급의료기관 317개소 등 전국 435개 응급의료기관을 대상으로 실시됐다.